微镜有两种：光学显微镜和电子显微镜。光学显微镜是利用光学原理对人眼无法分辨的微小物体进行放大成像，使人们提取微结构信息的光学仪器。电子显微镜是以电子束为照明源，通过电子电流对样品的透射或反射以及电磁透镜的多级放大，在荧光屏上成像的大型仪器。那么它们之间有什么区别呢?

　　1、成像原理

　　光学显微镜的基本原理是利用被检查样品的不同结构吸收光线的各种特征，以亮度差的形式表达样品的物相。在电子显微镜中，利用细聚焦电子束，在样品表面逐点扫描，与样品相互作用，产生各种物理信号。

　　2、光源

　　光学显微镜的光源是可见光(日光或照明)，电子显微镜使用的光源是电子枪发出的电子类，电子类的波动比光波波长长期短，因此电子显微镜的放大和分辨率比景象高得多。

　　3、透镜

　　在电子显微镜中起放大作用的物镜是电磁透镜，电磁透镜共有三组，分别与光学显微镜中聚光镜、物镜和目镜的功能相当。而光学显微镜的物镜是玻璃磨成的光透镜。

　　4、景深

　　一般光学显微镜的景深在2-3um之间，因此对样品的表面平滑度要求很高，样品制作过程比较复杂。电子显微镜的深度可以上升到几毫米，所以对样品表面的光滑几何图形没有要求，样品的准备相对简单，有些样品几何图形不需要制作样品。

　　5、样品使用不同的制备方法

　　电子显微镜观察中使用的组织细胞标本的制备程序复杂，技术难度和成本高，采访、固定、脱水、包埋等需要特殊的试剂和操作。另外，还要将包装好的组织块切成人超薄切片机50~100nm厚的超薄标本。而光镜观察的标本则一般置于载玻片上，如普通组织切片标本、细胞涂层标本、组织挤压标本、细胞液滴标本。

　　6、应用领域

　　光学显微镜主要用于光滑表面的微米组织观察和测量。因为使用可见光作为光源，所以不仅可以观察样品表面组织，还可以观察表面以下一定范围内的组织，对颜色识别非常敏感和准确。

　　电子显微镜主要用于纳米级样品表面形态观察。根据物理信号的强度来区分组织信息，所以图像是黑白的，对彩色的图像识别显得无能为力。